Выделяются следующие уровни систем мониторинга.

Глобальный (базовый, фоновый) мониторинг – предназначен для оценки изменений биосферы в глобальном масштабе. Проводится на значительном расстоянии от промышленного центра, крупного населенного пункта и т.д. Глобальный мониторинг организуется на базе биосферных заповедников, где выполняются:

· мониторинг загрязнений окружающей среды;

· мониторинг откликов биоты на антропогенные воздействия (фоновые загрязнения);

· наблюдения за изменениями характеристик нетронутых экосистем (сообщество живых веществ в единстве с их средой обитания – экосистема).

Целями наблюдений, проводимых в рамках глобального (фонового) мониторинга природных сред и экосистем являются:

· оценка состояния и функционирования целостности среды обитания и экосистем;

· выявление изменений природных условий в результате антропогенной деятельности на планете.

2. Национальный мониторинг осуществляется в рамках конкретного государства. Отличается от глобального не только масштабами, но и поставленными целями: получение информации и оценка состояния окружающей среды в национальных интересах.

3. Трансграничный мониторинг используется соседними государствами для изучения переноса загрязнений на границах между ними.

4. Региональный мониторинг проводится в интересах конкретного региона внутри государства.

На региональном уровне мониторинга решаются все основные задачи по наблюдению, оценке, прогнозу и формированию информационного поля экологического состояния окружающей среды и динамики природных систем в регионе, с учетом антропогенных воздействий и естественных изменений.

В задачи комплексного экологического мониторинга, решаемые на региональном уровне, также входят:

- контроль за фоновыми загрязнениями;

- наблюдение, оценка и прогноз трансрегиональных и трансграничных переносов вредных химических, радиоактивных веществ и др.

- формирование распределенной базы данных об экологической обстановке а регионе.

На данных, получаемых при проведении экологического мониторинга на региональном уровне, основывается выработка природоохранных мероприятий, принимаются меры, нацеленные на оптимизацию взаимоотношений человека с природой и использования возобновляемых природных ресурсов, управленческие решения в области природопользования, улучшения условий жизни и укрепления здоровья населения, развития фундаментальных и прикладных экологических исследований.

5. Импактный мониторинг – мониторинг локальных антропогенных воздействий в пределах предприятия, группы предприятий, в промышленных комплексах.

Импактный экологический мониторинг организуется и осуществляется на местном уровне. Область действия этого структурного звена мониторинга должна охватывать определенную совокупность биосферных и техносферных объектов, непосредственно связанных между собой процессами взаимодействия.