Большинство СУБД позволяют администратору системы выбрать один из двух способов размещения файлов БД на дисках: на «чистых» дисках или в файловой системе ОС. В первом случае управление данными, хранящимися на отдельных носителях, производится низкоуровневыми средствами самих СУБД. Некоторые СУБД, например Ingress и Interbase, требуют обязательного исполнения файловой системы (в среде ОС UNIX). Рассмотрим достоинства и недостатки обоих вариантов размещения файлов на диске.
Достоинством хранения информации на «чистых» дисках является то, что внешняя память используется более эффективно и, как правило, увеличивается производительность обмена с дисками. Экономия внешней памяти от 10 до 20 % достигается на основе устранения необходимости организации самой файловой системы.
Многие СУБД предпочитают работать с дисками через файловую систему, которая обеспечивает следующие достоинства. Во-первых, использование файловой системы обладает большей гибкостью, так как дает администратору стандартные средства обслуживания файлов: утилиты резервного копирования, архивации, восстановления, а также возможность пользования другими программами работы с файлами (редакторами, антивирусными программами, утилитами контроля качества носителя и т. д.). Во-вторых, в некоторых случаях выполнение операции ввода/вывода через файловую систему обеспечивает оптимизацию, которую СУБД не может реализовать.