При каждом действии установки/удаления система делает точку восстановления, которые занимают место. Я оставляю его включенным, но при этом оставляю на системном диске минимальный возможный размер, а на диске D побольше. В принципе можно отключить восстановление системы на системном диске, но тогда не будет работать опция сохранения параметров системы.
