Аминокислоты полностью распадаются до NH3, СО2 и Н2О. Вода является необходимым веществом для всех обменных процессов, углекислый газ участвует в построении карбонатной буферной системы, используется для синтеза жирных кислот, пуриновых и пиримидиновых оснований, углеводов. Оставшийся СО2 выводится из организма легкими. Аммиак является одним из источников азота в организме, токсичен для организма.
Пути обезвреживания аммиака в организме
1.
Восстановительное аминирование:
Аналогичный процесс протекает с участием аспарагиновой кислоты.
Таким путем происходит связывание NН3 в клетках мозга, печени.
2. 
Образование аммонийных солей.
3. Основным процессом связывания NН3 является биосинтез мочевины
Мочевина выводится из организма с мочой. Из азотсодержащих веществ мочина долю мочевины приходится 30–85%.
Суммарное уравнение синтеза мочевины (процесс происходит в печени):
Процесс синтеза мочевины подразделяется на три этапа:
I этап. Из одной молекулы NН3 и СО2 при участии АТФ синтезируется харбамоилфосфат, который, соединяясь с орнитом, образует цитруллин.
II этап. Происходит связывание одной молекулы NН3 путем восстановительного аминирования, в итоге образуется аспарагиновая кислота.
III этап. Цитруллин и аспарагиновая кислота взаимодействует с образованием аргинина. Аргинин расщепляется аргиназой с выделением мочевины, которая из печени поступает в кровь и выводится из организма через почки.
