Программа ARJ имеет три основных режима помещения файлов в архив:
 Add – добавление в архив всех файлов;
 Update – добавление в архив новых файлов;
 Freshen – добавление новых версий имеющихся в архиве файлов.
 Эти режимы имеют следующие особенности:
 • в режиме добавления (Add) в архивный файл добавляются все указанные в команде файлы;
 • в режиме добавления новых файлов (Update) в архивный файл добавляются те файлы, у которых либо нет копий в архиве, либо эти копии имеют более раннюю дату, чем у файла. Задание этого режима позволяет предотвратить затирание более новых версий файлов в архиве;
 • в режиме обновления версий файлов (Freshen) в архив добавляются новые версии тех файлов, которые уже имеются в архиве. Иначе говоря, в архив добавляются те файлы, копии которых уже находятся в архиве, но имеют более раннюю дату, чем у соответствующего файла на диске. Этот режим позволяет добиться того, чтобы архивный файл содержал наиболее свежие версии своих файлов.
 Задание этих режимов осуществляется следующим образом:
   | Режим | ARJ |  | 
  | Add
 Update Freshen | команда команда команда | А
 U
 F |