Все продолжающаяся минимизация систем не дается даром. Наиболее значительными недостатками являются ограниченное количество портов ввода/вывода, ограниченный объем памяти и ограниченные возможности установки дополнительных дисководов. Кроме того, невозможно использовать обычные, полноразмерные платы адаптеров, для которых характерны невысокая цена и доступность.
Одной из наибольших проблем ноутбуков является тепловыделение внутри корпуса. Поскольку обычные источники питания (и их вентиляторы) не подходят для ноутбуков, для отвода тепла от блоков пришлось разработать отдельные вентиляторы. Тесное расположение компонентов и малый объем свободного пространства внутри корпусов ноутбуков также усугубляют проблемы, связанные с отводом тепла.
Внутренние платы ноутбуков разработаны с учетом скорее особенностей портативного корпуса и его компонентов, нежели требований соответствия стандартной конструкции со стандартным размещением элементов и соединителей. Поэтому вопросы взаимозаменяемости деталей с деталями других компьютеров или изготовителей отодвигаются на задний план. Единственным поставщиком большинства деталей портативного компьютера, за исключением плат PC Card и дисководов, является первоначальный изготовитель. Даже корпус батареи может оказаться нестандартным. Если батарея выходит из строя, приходится надеяться, что изготовитель располагает запасом батарей данной конкретной модели.
Как правило, доступ ко внутренним компонентам ноутбука затруднен. Каждый корпус собирается и разбирается по-своему. Применительно к компьютеру ноутбук может оказаться сложной даже простейшая задача модернизации. Хотя наращивание ОЗУ и установка дополнительных устройств в настольных и башенных блоках — сравнительно простой и очевидный процесс, выполнение этих же задач применительно к компьютерам ноутбук может существенно усложниться.
В некоторых ноутбуках для установки дополнительных модулей ОЗУ потребуется разобрать корпус на две половины и снять клавиатуру. Для разборки других портативных компьютеров необходимо снятие откидного дисплея. Даже внутри ноутбука доступ к некоторым компонентам может перекрываться другими блоками.
С целью преодоления нежелательных последствий минимизации специально для рынка ноутбуков было разработано широкое множество элементов. К числу других подобных элементов относятся внутренние и внешние модемы, специальные сетевые адаптеры, доки (или порты), специальные корпуса и портфели для переноски, съемные клавиатуры, подключаемые или встроенные манипуляторы и панели сенсорной мыши.
Кроме того, для использования в рамках портативных компьютеров был разработан набор специальных, имеющих габариты кредитной карточки, плат адаптеров. Эти адаптеры стандартизованы в соответствии со спецификацией международной ассоциации производителей плат памяти для персональных компьютеров (Personal Computer Memory Card International Association, PCMCIA) и обычно называются платами PC Card.