Фармацевтическая торговая организация как субъект микроэкономики характеризуют количественные и качественные показатели деятельности.

Количественные: капитал, численность работников.

К основным качественным параметрам микроэкономики организации относятся:

1. Характер и содержание деятельности.

2. Базовая форма собственности.

3. Организационно-правовой статус организации.

4. Способы и методы ведения конкуренции.

5. Эффективность деятельности.

Характер и содержание деятельности организации определяется отраслью, в которой оно функционирует. В свою очередь каждое предприятие, каждая организация одной отрасли конкретизирует содержание своей деятельности, которое фиксируется в уставе или учредительном договоре предприятия. Так организации, осуществляющие фармацевтическую деятельность, по характеру своей деятельности наряду с поликлиниками, больницами относятся к организациям системы здравоохранения, а по содержанию своей деятельности являются торговыми предприятиями, которые предназначены для оказания фармацевтической помощи, в т.ч. для реализации фармацевтической и парафармацевтической продукции. Поэтому хозяйственная деятельность фармацевтической торговой организации, с одной стороны должна строиться на базе Российских законодательнх актов по охране здоровья, которые гарантируют определенный уровень оказания фармацевтической помощи, например, Конституция РФ, Основы законодательства РФ об охране здоровья граждан, Федеральный закон «О лекарственных средствах». А с другой стороны отнесение аптек к предприятиям розничной торговли предполагает раздельный учет продажи лекарственных препаратов и изделий медицинского назначения населению, организациям здравоохранения; использоание различных надбавок к цене при продаже населению или при отпуске лекарственных препаратов и изделий медицинского назначения за наличный расчет или с правом бесплатного отпуска. Это создает много проблем, связанных с противоречиями между торговой функцией и социальной направленностью деятельности организаций фармацевтической отрасли.