Таблицы можно проверять, когда сервер запущен. Программа MySQL не будет пытаться их восстановить. Но если обнаруживается поврежденная таблица, программа запрещает потокам обращаться к ней до тех пор, пока таблица не будет восстановлена. Для восстановления требуется получить монопольный доступ к таблице. В этой ситуации служебными инструкциями пользоваться удобнее, чем утилитой myisamchk, так как MySQL сможет заблокировать другие потоки на время восстановления таблицы. Утилита myisamchk может работать таким образом, только если операционная система поддерживает блокировку файлов. В Linux соответствующих функций нет, поэтому перед восстановлением таблиц нужно останавливать сервер.
Инструкция REPAIR TABLE устраняет повреждения в таблице. То же самое делает утилита myisamchk, при наличии опции --recover. Программа MySQL поддерживает три типа процедур восстановления: быструю, обычную и безопасную. В первом случае устраняются лишь проблемы с индексами. Во втором случае исправляется также большинство ошибок в табличном файле. В безопасном режиме таблица проверяется строка за строкой, а индексный файл создается заново. Это наиболее длительная процедура.
При удалении записей из таблицы программа MySQL сохраняет в ней пустые участки, которые повторно задействуются при последующем выполнении инструкций INSERT. Если таблица содержит пустые участки, то перед вставкой записей ее нужно заблокировать. Правда, когда записи вставляются в конец файла данных, программа разрешает другим потокам параллельно осуществлять чтение таблицы.
Таблицы с записями переменной длины неизбежно оказываются фрагментированными. Это происходит, когда обновляемая запись не помещается в отведенном для нее пространстве. В результате снижается производительность операций выборки, поскольку программа вынуждена искать запись в двух и более точках файла. Инструкция OPTIMIZE TABLE удаляет из таблицы пустые участки и осуществляет пересортировку записей. Аналогичные действия выполняет утилита myisamchk при наличии опции --analyze. Инструкция OPTIMIZE TABLEтакже сортирует индексы (соответствующая опция утилиты myisamchk называется --sort-index).