Общая проблема, касающаяся JavaScript – межсайтовый скриптинг или XSS, нарушение политики общего происхождения. Уязвимости XSS имеют место в ситуациях, когда злоумышленник имеет возможность поместить скрипт на страницу, демонстрирующуюся пользователю. В этом случае скрипт получает доступ к сайту с правами этого пользователя, что в ряде случаев открывает возможность отсылки конфиденциальной информации, осуществление нежелательных транзакций.
Уязвимости XSS также происходят из-за ошибок, допущенных разработчиками браузеров.
Другим типом межсайтовой уязвимости является подделка межсайтовых запросов или CSRF. Она заключается в возможности сайта злоумышленника заставить браузер пользователя осуществить нежелательное действие на целевом сайте (например, банковский перевод денег). Такая возможность имеется, если целевой сайт полагается только на HTTP cookie или запросы авторизации. В этом случае запросы, инициализированные кодом сайта злоумышленника, выполняются так же как запросы пользователя, если он авторизован на целевом сайте. Одним из средств защиты от CSRF является осуществление аутентификации при любом запросе, который приводит к необратимым последствиям.