Усовершенствованная система управления программными пакетами APT (Advanced Packaging Tool) первоначально была разработана для управления установкой и удалением программ в дистрибутиве Debian GNU/Linux. При разработке ставилась задача заменить используемую в Debian систему выбора программных пакетов dselect на новую, обладающую большими возможностями и простым пользовательским интерфейсом, а также позволяющую производить установку, обновление и повседневные "хозяйственные" работы с установленными на машине программами без необходимости изучения тонкостей используемой в дистрибутиве менеджера программных пакетов.
Эти привлекательные возможности были долгое время доступны только пользователям Debian GNU/Linux, поскольку в APT поддерживался только один менеджер пакетов, а именно применяемый в Debian GNU/Linux менеджер пакетов dpkg, несовместимый с RPM. Эта несовместимость заключается прежде всего в различии используемых форматов данных (хотя сущесвуют программы-конверторы), хотя имеются и другие различия, обсуждение которых выходит за рамки изложения.
APT, однако, изначально проектировался, как не зависящий от конкретного метода работы с установленными в системе пакетами, и эта особенность позволила разработчикам из бразильской компании Conectiva реализовать в нем поддержку менеджера пакетов RPM. Таким образом пользователи основанных на RPM дистрибутивов (а в их число входит и ALTLinux) получили возможность использовать этот мощный инструмент.
APT и в настоящее время находится в стадии разработки, а текущая версия с поддержкой RPM классифицируется, как нестабильная. Это, тем не менее, не означает, что операции, выполняемые посредством APT, безусловно приведут к нестабильности системы. Более того, с помощью APT возможен строгий контроль за целостностью системы: проверка нарушенных зависимостей между установленными пакетами и исправление выявленных ошибок.