В своей деятельности по природопользованию человек привносит в природные процессы негативные моменты. Так, атмосферный воздух существенно загрязнен вредными выделениями в виде газов и пылей. В большинстве крупных промышленных городов России фактические концентрации вредных веществ в воздухе превышают предельно-допустимые значения до 100 раз. В Нижнем Тагиле ежегодно выбрасывается до 1,5 т копоти на каждого жителя, включая новорожденных. Накопление парниковых газов в атмосфере приводит к дисбалансу кругооборота солнечной энергии на Земле и всемирному потеплению климата.
Многочисленные промышленные, сельско-хозяйственные и бытовые стоки в водную среду привели к вымиранию многих видов рыб , загрязнению водоемов неорганическими и органическими примесями (минеральные соли, кислоты, щелочи, глинистые частицы, нефтепродукты пестициды, ПАВ и т. п.). Изменяются свойства водной среды в результате увеличеия в ней количества микроорганизмов, растений и животных (бактерии, грибы, черви), привнесенные извне.
В последние глды участились аварии судов и танкеров, что ведет к кактастрофическим загрязнениям морской поверхности и побережья нефтью. Вследствие этого гибнет прибрежная растительность, птицы, морской планктон, исчезают многие виды рыб и морских животных.