Чистый Пролог разрешает применять в правилах и целях только конъюнкцию, однако, язык, используемый на практике, допускает применение дизъюнкции и отрицания в телах правил и целях. Для достижения цели, содержащей дизъюнкцию, Пролог–система сначала пытается удовлетворить левую часть дизъюнкции, а если это не удается, то переходит к поиску решения для правой части дизъюнкции. Аналогичные действия производятся при выполнении тела правил, содержащих дизъюнкцию. Для обозначения дизъюнкции используется символ « ; ».
В Прологе отрицание имеет имя «not» и для представления отрицания какого-либо предиката P используется запись not(P). Цель not(P) достижима тогда и только тогда, когда не удовлетворяется предикат (цель) P. При этом переменным значения не присваиваются. В самом деле, если достигается P, то не достигается not(P), значит надо стереть все присваивания, приводящие к данному результату. Наоборот, если P не достигается, то переменные не принимают никаких значений.
Общий принцип выполнения программ на Прологе прост: производится поиск ответа на вопросы, задаваемые БД, состоящей из фактов и правил, то есть проверяется соответствие предикатов вопроса предложениям из БД. Это частный случай метода резолюций.
Отметим, что в Прологе не проводится синтаксического различия между предикатом и функцией (составным термом), а также между нечисловой константой и функцией без аргументов. Следовательно, суть действия состоит в том, что ищется попарное соответствие между термами, один из которых является целью, а другой принадлежит БД.
Установление соответствия между термами является основной операцией при вычислении цели. Она осуществляется следующим образом: на каждом шаге выбирается очередной терм и отыскивается соответствующее выражение в БД. При этом переменные получают или теряют значения. Этот процесс можно описать в терминах текстуальных подстановок: « подставить терм t вместо переменной Y». Свободными переменными в Прологе называются переменные, которым не были присвоены значения, а все остальные переменные называются связанными переменными. Переменная становится связанной только во время унификации, переменная вновь становится свободной, когда унификация оказывается неуспешной или цель оказывается успешно вычисленной. В Прологе присваивание значений переменным выполняется внутренними подпрограммами унификации. Переменные становятся свободными, как только для внутренних подпрограмм унификации отпадает необходимость связывать некоторое значение с переменной для выполнения доказательства подцели.